大約在西元前6世紀，即佛陀時代，印度教就已經傳到尼泊爾。當時，居住在吠舍離（今屬北印度比哈爾邦邦）的李查維人（漢譯佛經中譯為離車、利車、離車毗等），被摩揭陀國阿舍世王打敗，逃到尼泊爾，在尼泊爾建立了李查維王朝。李查維人把他們所信仰的印度教也帶到尼泊爾。李查維王朝的國王們，多數崇信濕婆神，也有少數推崇毗濕奴神。在當時的尼泊爾，既有印度教信仰，又有佛教信仰，二教並行不悖。

西元8世紀，尼泊爾國王把印度教改革家商羯羅大師請到尼泊爾，大力宣講印度教，並排斥佛教，故使印度教有一個較大的發展。14世紀，馬拉王朝著名的國王賈耶斯提蒂. 馬拉（1382—1422）極力推廣印度教，他使種姓制度在尼泊爾確定下來。此後，馬拉王朝的歷代國王都尊崇印度教，不斷地修建神廟，迎請印度的婆羅門擔任神廟祭司，供奉梵天、濕婆和毗濕奴大神，使印度教在尼泊爾的影響逐步超過佛教。13世紀穆斯林統治印度以後，大批的印度王公和婆羅門為了逃避伊斯蘭教的迫害而湧入尼泊爾，也使印度教在尼泊爾的勢力擴大。到了18世紀，印度教在尼泊爾已佔據主導地位。

現在，印度教是尼泊爾的國教，全國人口的89.5%都信奉此教，約有信徒1600多萬人。其次是佛教，有5.7%人信仰。印度教徒遍佈於尼泊爾各地，主要集中於西部和南部的谷地，而佛教徒則多在山區。

首都加德滿都寺廟林立，到處可見，據說有大小寺廟2500多個，印度教神廟是主要的，也有少數是佛教的。加德滿都附近，有兩座最著名的印度教神廟。一座名為帕蘇帕底寺，位於加德滿都東北2英里處，此寺供奉濕婆大神。寺院的主體建築為塔式，四周有許多小寺環抱，濕婆神的愛獸——神牛南吉的高大塑像與群寺並立，十分雄偉壯觀。這裏的香火非常旺盛，每年都有大批國內外的印度教信徒來此朝聖。另一座名為章古納拉揚寺，位於加德滿都以東8英里，該寺供奉毗濕奴大神，寺中的神像雕塑得精美絕倫，故而遠近聞名。

尼泊爾的印度教徒對神靈十分虔誠。每家每戶的大堂上皆供奉神像，他們每天都要向神祈禱多次，而且嚴格規定不敬神者不能進食。不分大人小孩，不論在家裏還是在廟中，都必須空腹敬神，否則就是對神靈的不誠。尼泊爾的印度教徒特別尊崇黃牛，這裏的風俗跟印度略有不同，印度的印度教徒更為尊崇白色的母牛。在尼泊爾，黃牛被視為神，黃色的母牛被尊稱為母親。黃牛不僅受到人們的尊崇，而且得到法律的保護。法律規定對黃牛不許殺、不許食，否則就會受到拘留、罰款和刑事處分等。在農村，一律不許用黃牛拉車、耕地，只用于放生行善。

另外，尼泊爾的印度教還有一個特殊的風俗，即崇拜“童女神”。尼泊爾語稱此為“古瑪利黛維”，“古瑪利”意為童女，“黛維”意為女神。尼泊爾全國共有三位童女神，分別供奉在加德滿都市、帕坦市和波格德布林市。她們都是從尼瓦爾族沙迦種姓中挑選出來的童貞女孩，大約三歲時就被列入族譜，七歲時被選中。選童女神的條件非常嚴格，要求她們必須是五官端正、牙齒整齊、皮膚潔淨、性格溫柔而勇敢。入選後，要從家裏接至廟中，有專人侍奉和培養。每年只在因陀羅節那一天，這些活女神被抬出來巡遊市區，與信徒們見面；平時，她們被關在廟中，只有當善男信女前來求神問卜時，才在廟內樓上的視窗中突然一現。在每年的因陀羅節，女神頭頂鑲滿珠寶的金冠、頸戴蛇狀的金鏈、身穿金褸紅衣、周身金光閃耀，她們坐在轎中，行進在大街上，受到成千上萬崇信者的朝拜。但是，一旦長大，青春期來臨後，她們就被送至家中，不再在廟中出現。據說，這種崇拜女神的風俗早在古代就開始流行，一直延續至今。